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这篇文章的主要思路为利用抗感亲本构建包含232个个体的F2群体,根据表型共构建混池6个,抗池3个,感池3个(作用等价于重复)。通过Hiseq2000,PE100测序策略进行测序分析,快速定位小麦抗病基因。图1 文章流程图 由于小麦没有完整的基因组序列,本文SNP发掘除了利用NCBI里公布的56954个UniGene库作为参考之外,还利用已经发表的94177个基因模式UCW库。数据过滤后,通过与这两个库的比对,最后在双亲之间分别获得66426和52262个可能的SNP位点。下图2 a显示利用以上不同的库进行SNP calling之后,得到的SNP在小...
